Логин:
Пароль:

Работа №1792
Название работы
Выделение и изучение на уровне генома новых сульфидогенных бактерий из микробиома человека
Автор работы
Карначук Ольга Викторовна
Дата начала работы Дата окончания работы
2011-01-01 2012-12-31
Аннотация
Проект посвящен изучению уникальной сульфидогенной бактерии, выделенной с поверхности монет и получению новых культур из организма человека. Роль сульфидогенов, принадлежащих микробиому человека, и их связь с различными патологиями остается невыясненной. До сих пор не было изучено возможное влияние сульфидобразующих организмов на связывание железа и других металлов в нерастворимые комплексы в организме человека. Предварительные результаты показывают, что выделенный нами ранее штамм Р1, принадлежит к новой филогенетической ветви сульфатредуцирующих бактерий внутри Firmicutes. Эта гипотеза будет первоначально проверена путем определения полной последовательности нуклеотидов в гене 16S рРНК – универсальном филогенетическом маркере и последовательности аминокислот в dsrAB, диссимиляционной бисульфитредуктазе, являющейся ключевым ферментом сульфатредукции и функциональным маркером этого микробного процесса. В случае подтверждения уникального филогенетического положения бактерии, будет секвенирован полный геном бактерии методом пиросеквенирования и изучены другие гены, связанные с сульфатным дыханием. Для определения возможной локализации бактерий, родственных Р1, в организме человека, будут получены накопительных культур сульфидогенных бактерий из фекалий, слюны и клинических образцов и проведен их молекулярный скрининг методом гель-электрофореза в денатурирующих условиях (DGGE). В случае обнаружения других доминирующих филотипов дополнительно будут выделены новые чистые культуры и изучен их генотип. Проект также предполагает изучение физиологии новых сульфидогенов и исследование возможности образования нерастворимых сульфидов железа и меди современными методами материаловедческого анализа. Проведение подобных исследований в Томской области перспективно с точки зрения объединения научной экспертизы и материальной базы для молекулярных исследований в лаборатории авторов заявки с доступом к современному оборудованию для материаловедческого анализа в центре коллективного пользования ТГУ, а также широкой возможности отбора клинических проб в сотрудничестве с Сибирским медицинским университетом.
Тип НИР Источник финансирования Объем финансирования Вид работы
Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ
Заказчик
Получить полный доступ
ГРНТИ УДК Инвентарный номер Госшифр Госконтракт Договор
Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ Получить полный доступ
Ключевые слова
МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ; СУЛЬФИДОГЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ; МИКРОБИОМ ЧЕЛОВЕКА; БИОГЕННЫЕ СУЛЬФИДЫ МЕТАЛЛОВ
Предполагаемый результат работы
Получить полный доступ
Организации соисполнители
Получить полный доступ
Государственный учет результатов НИОКР в БД РНТД Минобрнауки РФ
Получить полный доступ
Основание к регистрации темы (электронный вариант)
Только для служебного пользования
   
2007 © ОНТИ НУ ТГУ
E-mail: onti@sun.lib.tsu.ru
Тел: 52-76-99